Betere zuivering afvalwater dankzij Systems Biology

Afvalwater bevat een wereld aan micro-organismen die samen het microbioom vormen. Veel van deze organismen helpen bij het zuiveren van het water doordat ze afvalstoffen afbreken. Verbeter je de leefomgeving van deze nuttige micro-organismen, dan verbeter je ook de efficiëntie van de zuivering. Sebastián zocht uit hoe je de leefomgeving kunt verbeteren. Gelukkig is er heel veel data voorhanden over het microbioom van afvalwater, dit was één van de redenen waarom Sebastián voor dit onderwerp koos. “Tijdens mijn opleiding richtte ik me vooral op onderzoek in de gezondheidszorg, nu wilde ik ook ervaring opdoen met onderzoek op het gebied van het milieu.”

Op basis van alle verzamelde data, maakte Sebastián een kennisgrafiek (knowledge graph), een model dat voorspelt hoe micro-organismen reageren op hun biologische ecosysteem. “Met het model, MicW2Graph, kunnen we groepen micro-organismen identificeren die mogelijk samenwerken bij de afbraak van afvalstoffen. We testten het MicW2Graph met de data van oudere studies, het model blijkt de uitkomsten van die studies inderdaad te voorspellen. We gebruiken MicW2Graph vervolgens om de belangrijkste soorten micro-organismen en metabole clusters te identificeren die we in het laboratorium verder onderzoeken. Zo kunnen we de zuivering van afvalwater optimaliseren door de leefomstandigheden van gunstige groepen micro-organismen te verbeteren.”