Trefwoorden: Biologische reactiepaden, Biocuratie, FAIR, Semantisch web van data
 

"Biological Pathway Abstractions: From Two-Dimensional Drawings to Multidimensional Linked Data"

Dit proefschrift richt zich op de studie van reactiepaden, ook bekend als ‘pathways’ een fundamenteel concept in de biochemie. Het bekendste voorbeeld hiervan, de citroenzuurcyclus, wordt standaard onderwezen op de middelbare school. In de hedendaagse wetenschap hebben deze pathways een dubbele functie: ze dienen niet alleen als illustratief hulpmiddel, maar spelen ook een cruciale rol in het analyseren van grote hoeveelheden wetenschappelijke data. Om deze analyse effectief te maken, is het essentieel dat de pathways continu worden bijgewerkt met de meest recente wetenschappelijke literatuur. Dit vereist specifieke instrumenten voor het monitoren van literatuur en voor het representeren van kennis op een manier die automatische verwerking mogelijk maakt. Het proefschrift onderzoekt diverse methoden en technieken om dit onderhoud, ook wel biocuratie genoemd, te ondersteunen. Centraal in deze studie staat het semantisch web, een uitbreiding van het World Wide Web, dat het snel hergebruiken van data mogelijk maakt. Tot slot onderzoekt het proefschrift technieken die de onderzoeksgemeenschap in staat stellen om gezamenlijk bij te dragen aan de ontwikkeling en het onderhoud van deze pathways.

Klik hier voor de livestream.